歷届系主任
第一任医学系主任：郭承統主任 (民國76 年 ~民國 87 年)
第二任医学系主任：黃秋錦主任 (民國87 年 ~民國 89 年)
第三任医学系主任：黃燦龍主任 (民國89 年 ~民國97 年)
第四任医学系主任：方基存主任 (民國97 年 ~民國104年7月)
第五任医学系主任：周宏學主任 (民國104年8月~民國108年7月)
第六任医学系主任：謝明儒主任 (民國108年8月~)
歷届副系主任
方基存副主任 (民國95 年 ~民國97 年)
周宏學副主任 (民國97 年 ~民國104年7月)
林俊彥副主任 (民國100 年 ~民國104年7月)
劉嘉逸副主任 (民國104年8月~民國109年7月)
吳憲銘副主任 (民國104年8月~民國107年7月)
謝明儒副主任 (民國107年8月~民國108年7月)
張玉喆副主任 (民國108年8月~)
林蔚然副主任(民国109年8月词)
歷屆医预科主任
第一任医预科主任：黃明達教授 (民國87 年 ~民國 89 年)
第二任医预科主任：張吳名任教授 (民國89 年 ~民國 94 年)
第三任医预科主任：周淑娥副教授 (民國94 年 ~民國97年)
第四任医预科主任：鄭授德副教授 (民國97 年 ~民國108年7月)
第五任医预科主任：吳嘉霖教授 (民國108 年8月 ~)