短程之发展目标：
- 成立临床资讯与医学统计研究中心：发展临床医学研究法及医学统计於疾病生物标记(叠颈辞蝉颈驳苍补迟耻谤别)、临床试验之应用。
- 配合老化整合型计划之研究：探讨右心压力负荷过度诱发心臟电生理与钙调控异常机制及治疗策略之研究。
- 配合癌症整合型計劃之研究：以affymetrix microarray系統 (SNP 6.0) 探討頭頸部腫瘤之基因變異 (copy number variations)。
- 结合干细胞和蛋白质体在治疗肝臟疾病再生医学的研究。
- 配合病毒整合型计划之研究：探讨肿瘤病毒特定蛋白质对於病毒复製及致病机转。
- 肝细胞癌模式中肝癌再復发与循环性体液和细胞因子之探讨。
中程之发展目标：
- 配合老化整合型计划之研究：建立菌血症动物模式，探讨心房与心室心律不整之感受性，心臟功能、电生理学作用之变化及治疗策略之研究。
- 配合癌症整合型計劃之研究：篩檢並探討頭頸部腫瘤之基因變異 (copy number variations)之臨床意義。
- 配合病毒整合型计划之研究：连结卡波西式病毒蛋白质间的功能分析。
- 臨床資訊與醫學統計研究中心：追蹤並完成那些經由驗證過的口腔鱗狀上皮細胞癌(oral squamous cell carcinoma，OSCC)生物標記之成果評估，以建立未來成本效益分析之直接比較；最終能以此改善OSCC病人之治療結果，並同時減輕醫療成本之負擔。
- 建立一个有效的光线治疗法调控肝臟发炎，纤维化和移植后排斥。
长程之发展目标：
- 扩大研究中心与未来医院之临床试验中心，癌症中心及转译中心之合作，提供研究方法学之理论供给与实务之应用。
- 配合老化整合型计划之研究：以心肌梗塞诱发心衰竭模式，探讨心臟电生理异常之离子机制。
- 配合癌症整合型計劃之研究，發展頭頸部腫瘤之基因變異 (copy number variations) 之 stratification markers (recurrence or metastasis)。
- 配合病毒整合型计划之研究，建立肿瘤病毒致病模式及利用病毒特性应用於治疗或基因治疗应用。
- 肝臟移植排斥与肝癌再復发生物标记开发。