• 培育兼具臨床醫學經驗與醫學研究能力之臨床相關研究人才（含：臨床科學家[Clinical Investigator]、醫師科學家[Physician Scientist]   護理科學家 [Nursing Scientist]、或呼吸暨重症照護臨床研究員），結合臨床與基礎醫學的研究，促進未來醫療進步，造福社會。
• 培育国内教育临床相关人员(含中、西医师、护理师、及呼吸治疗师等）之临床与基础医学研究相关知识与技术，使具备医学研究之能力。
• 培育本所研究生具有独立思考与研究能力之医学研究人才，奠定未来从事高深临床医学研究的基础。
• 培育本所研究生具執行臨床研究(含translational study and clinical study)能力，增進臨床醫學研究及臨床試驗水準，提升病患健康福祉。
• 辅导本所研究生具备人文素养及医学伦理的内涵，养成独立健全的人格，成為社会医疗服务界之菁英份子。
• 养成本所研究生拥有终身学习的热诚以及国际化宏观视野与研究发展之创造力。