新興與再興病毒對整個世界的威脅極大，除了COVID-19全球大流行的震撼之外，之前SARS-CoV-1、禽流感、腸病毒、新型豬流感等病毒嚴重危害到人類的生命，對社會經濟、交通、生態及教育層面也均造成很大的衝擊。人類必須面對這些病毒的捲土重來，也可能會再遭遇嶄新的病毒攻擊。长庚大学新興病毒研究中心自2009年成立以來，長期研究這類易突變的RNA病毒（會導致新興與再興的感染症）。人才培育的結果在此次百年大疫COVID-19發揮了很大的貢獻，包括病毒快速鑑定、病毒株分離、基因資料庫建立以追蹤感染源，疫苗抗病毒研發等。我們期許永續經營此研究中心，通過不同領域的專家共同合作，繼續培育人才，完成以下使命：
(1)辨识新兴病毒感染疾病：结合最新生物技术及人工智慧开发新颖检验试剂於临床使用。
(2)进行新兴病毒跨领域之研究：从分子层次、细胞层次、动物模式到人体试验，结合分子病毒学、免疫学、资讯学、生医工程及临床医学等共同对新兴病毒的致病毒机转有所了解，而研发减缓及治疗新兴感染症的方法。
(3)建立基础科学及临床科学的桥樑：本中心与临床工作者自1998年台湾地区爆发肠病毒71型大流行时，已形成良好的合作模式，此次颁翱痴滨顿-19疫情更加强合作的面向。此后将持续将有潜力的抗病毒药物或治疗方式推向临床应用。临床的现象，也会透过基础科学研究而获得解答，进而帮助病人。
(4)藉由紮實的国际合作以促進新興病毒感染症之研究：目前中心加入全球感染症網的研究(CREID)，會持續交換研究人員，培育國內外人才，如同此次COVID-19病情一般，可以在最短時間內建立最有效率的合作，共同對抗疫情。