本系目前座落於第二医学大楼五楼。楼层活动空间為480坪。其中设有全国唯一呼吸治疗实验教室共3间, 示范病房1间,阶梯教室(90人)1间,讨论室3间,教师研究室共9间,电脑与图书资料室1间, 实验室共4间,仪器室1间等。