成立缘由
内政部统计显示至1999年底，领有残障手册的身心障碍人口已超过61万人，佔全国总人口的2.8%。其中肢障者所佔比例最高（43.4% ），智障者次之（10.96%），身心障碍人口每年又以约20% 比率成长。然而，实际接受医疗照顾者尚不及一万人，其原因除相关专属照顾机构缺乏外，辅具研发与应用人才亦相当匱乏。另外，随着国内人口的高龄化，加上社会组织、伦理观念、生活型态及经济环境的变迁，老人健康及医疗问题越来越受到重视。因此研发具前瞻性之復健科技辅具并积极推广至医疗照顾机构及伤残患者家庭，以及加强慢性患者与老人之长期照护的基础与临床研究，对推展全方位医疗政策，实刻不容缓。
目前物理治疗大学部训练之目标，是养成学生之专业技能以从事临床工作為主，復健科技与医疗专业高级学术及研究人才的培育相当匱乏。復健科学除缺乏较深入性的学术研究外，将復健工程科技的研发导入临床医疗实务的应用亦不多。因此，為提升物理治疗专业人员的临床研究能力，於民国九十一年八月成立硕士班，目前专任教师12名，每年招收14名学生。
成立宗旨
拓展多元化物理治疗与復健相关专业学术研究风气，培育物理治疗与各復健专业领域教学、研究与科技之高级人才。&苍产蝉辫;
发展方向与重点
秉持「理论与实务结合」之教育精神，以拓展多元化復健相关专业学术研究风气為目标，為我国培育復健专业领域之高级人才。本系除了提供长庚大学教学、研究的师资与设备外，亦连结其他长庚体系资源，以求与临床实务结合及与其他专业有效的合作。举例来说，本系与长庚纪念医院合作，使研究生在校期间获得临床实务经验，培育良好之专业素养，提升其復健专业学术研究及临床实务能力之水準。另外，已成立桃园长庚纪念医院、养生文化村与护理之家，提供本系有关老年及慢性疾病之长期照护医疗问题的研究及临床实务环境。因此，本系学生可充分达成理论与实务的结合，并且藉此培养学生人文素养及关怀生命的道德情操，营造优质的教育成果。
教育目标
1.秉持理论与实务合一之教学方针，培育物理治疗专业的教学师资及临床领导人才。
2.整合基础、临床医学与工学等知识，建立物理医学之理论基础。
3.研发前瞻性科技辅具，开拓临床医疗市场。
学生核心能力
补.物理治疗专业知能与临床技能
产.物理治疗伦理、风范与领导能力
肠.生物医学研究与研发能力
d.人道关怀、行為及社会科学知识
别.资讯应用、国际观与终身学习能力