1. 運用現代科學方法，探討中醫學理論的思維。
2. 專注中醫臨床觀察與研究，提升研究生發揮中醫藥優勢。
3. 研究生對重要疾病問題及基礎領域的學習，藉以培育傑出學術研究人才，為人類健康做最優值的貢獻。
4. 本系教師研究能量佳並榮獲多項獎項肯定，如列入全球前2%顶尖科学家、中医药发展奖励玉阶奖--卓越贡献奖、王民寧奖、国科会优秀年轻学者研究计画补助、国家新创奖、优良教师辅导、教学、研究奖等。
5. 提供百分百學校住宿，優渥獎助學金，除申請教學助理外，另每月6000元以上研究奖助学金。
6. 鼓勵大學部學生修習學碩士學程，碩士生可申請逕行修讀博士班。