通识教育中心與各學院同為校一級學術教育單位，設有主任及中心秘書各乙名，下轄人文藝術、社會、自然及英文学科，各學科均設乙位召集人，共同推動通识教育中心各項教學研究事務。
【人文艺术学科】
人文艺术学科負責開授全校人文與藝術核心暨多元選修課程，提升本校學生本國語文閱讀與寫作能力，厚植人文藝術的鑑賞與哲學省思能力。每年舉辦长庚文学奖，並結合藝文中心推動全校性藝文活動及講座，培養師生人文藝術情操，創造溫馨校園氛圍。
【英文学科】
英文学科(语文中心)负责本校大学部学生英文必、选修课程，同时為部分学系提供专业英语课程。為致力提升学生基本英语能力，本校订有英文毕业标準，协助学生英语学习通过门槛；此外，语文中心設有獎勵機制，鼓勵學生積極爭取高分，通過英文畢業門檻。每學期语文中心均舉辦多項英語學習競賽及活動，藉以增加校園英語學習風氣並提升學生英語能力。
【社会学科】
连结本校医、工、管与智慧运算学院之专业特色，规划社会科学领域核心课程及多元选修课程，採主题及专题式教学策略，增进学生瞭解各种社会科学研究方法之运用，认识人类社会活动多元面貌，培养民主、法治观念，使具备现代公民素养。
【自然学科】
结合各系专业需求开设基础科学课程，使学生瞭解自然科学各学门间之横向联繫及与专业课程的纵向整合，奠定学生扎实的基础科学能力。开授通识多元选修自然科学、运算思维及跨域学习与实践领域等相关课程，培养学生理性思考及科学判断能力。