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进阶代谢体学实验

课程资讯
学年/学期 112/2
授课教师 郑美玲
开课单位 生医所博士班
年级-班别 1-甲
科目代号(学分) BMD520(1)
课程名称 进阶代谢体学实验
开课序号 61400
主要开课序号
修课学生 本校:&苍产蝉辫;5人;外校:&苍产蝉辫;0人
人数限制 0~60
上课时间地点
星期 开始&苍产蝉辫;/&苍产蝉辫;结束 教室&苍产蝉辫;摆代码说明]
星期二 3 (10:10) ~ 4 (12:00) 每週上课
核心能力
备註 5贵健康老化中心会议室
教学大纲
教科书 自编教材,以专业论文与书籍為主要内容。
教科书ISBN 0000000000
参考书
课程讲义网址
整体教学目标 本课程主要培养生物医学背景学生具备执行及分析代谢体学实验与数据基本学理知识,进而可以很快衔接代谢体学实验内容,已达培养代谢体学实验检测与数据分析人才。
教学方法 代谢体学检测仪器及数据分析操作,使学员能循序渐进地针对核磁共振仪及质谱仪的操作及应用深入浅出的瞭解,已使学员能在实验前有充足的学理及操作技术知识。
课程介绍 代謝體學是後基因體世代的新興領域,主要關注於低分子量代謝產物於生物系統的全面表徵。做為基因表現的下游,代謝體學與轉錄體學和蛋白質體學之間具互補性,並更密切地反映細胞的活動狀態。由代謝體學研究所獲得的資訊,能提供全面性在正常生理和病理生理狀態之間所具有差異之生化途徑及其相互作用。因此,由上向下的信息可以檢測疾病的進程,對治療的反應,鑑定新的疾病標誌,以及應用於藥物開發。從全譜型代謝物表現到目標代謝物的鑑定和定量,研究方法可提供生物标誌的組合來描述疾病進程間多項危險因子的相互作用。近期許多的營養和生活方式的研究仰賴於代謝體學做為一關鍵平台技術,且代謝體學在個人化醫療也提供了有效的研究方法,產生重要的影響。本課程(1學分)將涵蓋代謝體學研究技術平台設備操作。课程内容將介紹代謝體學技術平台設備與數據分析,以及在基礎研究和臨床醫學上技術平台的應用,例如核磁共振光譜儀、液相層析質譜儀、質譜影像等。學生將於課後獲得生物學到代謝體學技術平台相關檢測技術操作能力。
弹性学习 Review and Final Discussion-郑美玲 另約時間與授課老師討論(分機3811)。
成绩考核 30% 三次實驗報告 20% 核磁共振儀操作考核 20% 質譜儀操作考核 20% 期末報告 10% 平時成績
师生互动时间 每週三17:00-19:00 分機3811
教学进度
项次 教学主题
1
1.上課方式:實體上課 2.授課內容:NMR-based metaolomic analysis-sample preparation 3.授课教师:駱啓仁
2
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: NMR-based metaolomic analysis- 1D proton spectrum acquisition and data processing 3.授课教师:駱啓仁
3
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: NMR-based metaolomic analysis- 2D heteronuclear spectrum acquisition and metabolites identification 3.授课教师:駱啓仁
4
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: NMR spectrometer operational exam 3.授课教师:駱啓仁
5
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: LCMS-based metaolomic analysis (I)- sample preparation 3.授课教师:郑美玲
6
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Untargeted LCMS-based metaolomic analysis (II) - TOF-MS operation 3.授课教师:郑美玲
7
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Untargeted LCMS-based metaolomic analysis (III) - TOF-MS operation 3.授课教师:郑美玲
8
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Untargeted LCMS-based metaolomic analysis (IV) – metabolites identification 3.授课教师:郑美玲
9
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Targeted LCMS-based metaolomic analysis (V) –TQ-MS operation 3.授课教师:郑美玲
10
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Targeted LCMS-based metaolomic analysis (VI) –metabolites quantitative analysis 3.授课教师:郑美玲
11
1.上課方式:實體上課 2.授課內容:LCMS spectrometer operational exam 3.授课教师:郑美玲
12
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Software practice for statistical, functional, and integrative analysis of metabolomics data using MetaboAnalyst 3.授课教师:張書瑋
13
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Mass image-based metaolomic analysis (I) – sample preparation 3.授课教师:郑美玲
14
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Mass image-based metaolomic analysis (II) –operation for mass image 3.授课教师:郑美玲
15
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Mass image-based metaolomic analysis (III) – data processing for mass image 3.授课教师:郑美玲
16
1.上課方式:實體上課 2.授課內容: Final examination 3.授课教师:郑美玲
先修课程
本課程沒有先修课程規定