91猫先生

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质谱定量蛋白质体学实验

课程资讯

学年/学期

113/1

授课教师

简昆鎰

开课单位

生医所博士班

年级-班别

1-

科目代号(学分)

BMD506(1)

课程名称

质谱定量蛋白质体学实验

开课序号

64117

主要开课序号

修课学生

本校: 6人;外校: 0

人数限制

2~20

上课时间地点

星期

开始 / 结束

教室 [代码说明]

未指定

0 (00:00) ~ 0 (00:00)

暑假上课

核心能力

备註

需与同名讲授课程合上

教学大纲

教科书

Quantitative Proteomics: New Developments in Mass Spectrometry (Royal Society of Chemistry, London, UK, 2014)

教科书ISBN

0000000000

参考书

近期期刊

课程讲义网址

ftp://120.126.1.5/Service/summer/2024

整体教学目标

质谱定量蛋白质体学近年来已成為研究生物医学的一大利器,选择适当的蛋白质体定量策略及正确的样品製备方法,与实验的成功与否息息相关。本实验课的目的在於配合讲授课程,提供实务操作的机会,使学员进一步瞭解进行蛋白体定量分析的实验规划及操作流程之注意事项。使学员具备将本技术运用於其研究主题的能力。

教学方法

实验步骤讲解与实际操作

课程介绍

本课程将利用特定蛋白质的专一性抗体,针对细胞萃取液进行免疫沉淀,再以稳定同位素标定结合质谱技术(液相层析质谱学)的蛋白质定量方法,找寻特定蛋白质之交互作用蛋白。学员如有特别感兴趣的目标蛋白,亦可自行準备抗体,作為实作课程的材料。主要实验规划為实地进行样品製备及蛋白质鑑定与定量流程之操作,使学员充分了解样品製备在质谱数据取得的重要性,以期使各学员能将本技术灵活运用於各自的研究领域中。

弹性学习

提供实验操作教学录影档以供课后复习,以及蛋白质体核心实验室见习

成绩考核

实验实作与实验报告

师生互动时间

师生互动时间 每周一14:00-15:00 办公室: 第一医学大楼0913室,校内分机: 5971email: kychien@mail.cgu.edu.tw

教学进度

项次

教学主题

1

1. 上课方式: 实体上课/实验操作(6小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 免疫沉淀与水解蛋白 Immunoprecipitation and protein digestion 3. 授课教师: 简昆鎰

2

1. 上课方式: 实体上课/实验操作(4小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 胜肽标定与样品净化 Peptide labeling and sample clean-up 3. 授课教师: 简昆鎰

3

1. 上课方式: 实体上课/实验操作(6小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 质谱数据取得 Data acquisition- operation of LC-MS/MS 3. 授课教师: 简昆鎰

4

1. 上课方式: 实体上课/实验操作(4小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 质谱定量软体操作 Operation of quantification software 3. 授课教师: 简昆鎰

5

1. 上课方式: 实体上课/实验操作(4小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 生物资讯软体操作 Data mining using Bioinformatics tools 3. 授课教师: 简昆鎰

6

1. 上课方式: 实体上课/实验操作(4小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 质谱定量数据之整合分析 Integration of quantification results 3. 授课教师: 简昆鎰

7

1. 上课方式: 实体上课/实验操作(4小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 口头报告与讨论 Oral presentation and discussion 3. 授课教师: 简昆鎰

8

1. 上课方式: 弹性教学(1小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 弹性教学/蛋白质体核心实验室操作/见习-1 3. 授课教师: 简昆鎰

9

1. 上课方式: 弹性教学(1小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 弹性教学/蛋白质体核心实验室操作/见习-2 3. 授课教师: 简昆鎰

10

1. 上课方式: 弹性教学(1小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 弹性教学/蛋白质体核心实验室操作/见习-3 3. 授课教师: 简昆鎰

11

1. 上课方式: 弹性教学(1小时) 2. 授课主题/学习目标/授课内容: 弹性教学/蛋白质体核心实验室操作/见习-4 3. 授课教师: 简昆鎰

先修课程

本課程沒有先修课程規定