91猫先生

学年/学期

113/1

授课教师

刘轩

开课单位

生医所博士班

年级-班别

1-甲

科目代号(学分)

BMD507(1)

课程名称

转录体学与数据分析应用

开课序号

64118

主要开课序号

修课学生

本校: 8人；外校: 0人

人数限制

0~60

上课时间地点

核心能力

备註

教科书

無特定的教科书，教師參考專業文獻資料自編教學講義。

教科书ISBN

0000000000

参考书

無特定的教科书，教師參考專業文獻資料自編教學講義。

课程讲义网址

本课程之EL系统

整体教学目标

透过本课程，学生将可学习到转录体学的基本原理、次世代定序技术原理与应用，以及数据统合的能力，并将转录体学技术平台应用到转译医学研究领域上。

教学方法

教师授课，实例讨论及资料库应用。

课程介绍

人类基因体定序计划完成后，转录体学研究方法成為近代生物医学研究领域中极重要的一环，它与蛋白质体学及代谢体学，构成后基因体时代基因功能研究与註解的重要方法。转录体学由於发展的时间较早，其技术平台与分析方法较成熟，目前广為应用在研究人类复杂疾病相关之议题。此课程将以转录体為中心，深入介绍如何使用不同的转录体学的技术策略与生物资讯分析方法，建构疾病的调控及预测模式，加速临床疾病精準治疗策略的开发。此外,本课程也将介绍以转录体為主轴，进而发展之单细胞及空间多模组体学之方法 (single-cell and spatial multi-omics technologies , also known as multimodal omics approaches)，深入解析疾病异质特性与细胞间之交互作用。

弹性学习

TEAMS会议线上讨论。

成绩考核

出席: 20%、书面报告: 80%。

师生互动时间

Friday 3-5 PM Email: liu-hsuan@mail.cgu.edu.tw 分机: 3526

项次

教学主题

1

1. 上课主题：Introduction of Human Transcriptome 2. 授课教师：刘轩 (2hr)

2

1. 上课主题：Technological Development in Transcriptome Analysis 2. 授课教师：刘轩 (2hr)

3

1. 上课主题：Applications of RNA-based Sequencing in Biomedical Research I-Bulk RNA-seq for Coding and Noncoding RNA 2. 授课教师：蘇仕奇 (2hr)

4

1. 上课主题：Transcriptome of Extracellular Vesicles 2. 授课教师：刘轩 (2hr)

5

1. 上课主题：Applications of RNA-based Sequencing in Biomedical Research II- Single-cell and spatial RNA-seq 2. 授课教师：蘇仕奇 (2hr)

6

1. 上课主题：Bulk RNA Sequencing Data Analysis I 2. 授课教师: 张益峯 (2hr)

7

1. 上课主题：Bulk RNA Sequencing Data Analysis II 2. 授课教师: 张益峯 (2hr)

8

1. 上课主题：Single cell RNA Sequencing Data Analysis I 2. 授课教师：刘轩 (2 hr)

9

1. 上课主题：Single cell RNA Sequencing Data Analysis II 2. 授课教师：刘轩 (2 hr)

本課程沒有先修课程規定